Sieht so aus wie der IE Bug beim Layouten von Boxen. Browser mit richtiger CSS-Implementierung (in dem Fall Firefox) berechnen die Breite einer Box indem sie angegebene 'width' nehmen und 'padding' und 'borders' und 'margin' dazu addieren.
Der IE dagegen interpretiert das im "Quirks mode" (heisst wirklich so) auf seine eigene Art. (Er nimmt die angegebene 'width' und malt also 'margins', 'borders', etc. in der box). Der IE6 faellt in diesen Modus, wenn kein korrekter DOCTYPE-Eintrag in der Ersten Zeile der HTML-Seite gemacht ist.
Wie gesagt ist das nur eine Vermutung. Wenn Du den Sourcecode linkst dann kann man vielleicht etwas 'unspekulativer' Antworten.